La Sexología clínica tiene como objetivo primario el tratamiento de las disfunciones sexuales.
Es decir, de aquellas alteraciones de la función sexual que tienen su origen en una educación sexual deficitaria, en conflictos individuales (depresión, ansiedad, fobias, etc.) y/o de pareja.

Existen tres objetivos principales en el tratamiento de las disfunciones sexuales:
- Proporcionar un enfoque estructurado que permita a la pareja reconstruir gradualmente sus relaciones sexuales. Consiste en una serie de pasos relativamente pequeños que la pareja puede abordar uno tras otro.
- Ayudar a la pareja y a su terapeuta a identificar los factores específicos que mantienen la disfunción sexual.
- Proveer a la pareja de técnicas específicas para tratar los problemas particulares.

La terapia sexual cuenta con el respaldo y la base de años de investigación y estudio, mostrando ser el método más efectivo para el tratamiento de distintas disfunciones sexuales tales como: la disfunción eréctil, eyaculación precoz, eyaculación retardada en el hombre e inhibición del deseo, anorgasmia, dispaurenia y vaginismo en la mujer.

Posteriormente en forma conjunta y paulatina, durante el tratamiento, se van asignando una

serie de tareas para realizar en la intimidad, que plasmarán en la práctica las conceptualizaciones teóricas de la solución de la disfunción. Estos encuentros sexuales son una manera de recanalizar las vías de comunicación de la pareja a través de la revalorización del vínculo por el afecto y el placer.